Le CIMEX (Centre Interdisciplinaire de Microscopie Électronique de l'École polytechnique) a été fondé en 2010 par quatre laboratoires fondateurs (BIOC, LPICM, LSI et PMC) pour satisfaire les besoins en microscopie électronique des laboratoires du Centre de Recherches de l'École. En 2011, le CIMEX et ses partenaires ont été lauréats de l'équipement d'excellence TEMPOS (Transmission Electron Microscopy at Palaiseau-Orsay-Saclay), couvrant l'acquisition et la maintenance de plusieurs microscopes électroniques de pointe sur la période 2011-2019. En 2019, le LMS a rejoint le CIMEX. En 2021, le CIMEX est devenu une Unité Propre de Service de l'Ecole polytechnique. Le CIMEX est également très impliqué dans l'enseignement et la formation, à travers l'organisation de travaux pratiques et de workshops en microscopie électronique et en préparation des échantillons.