En poursuivant votre navigation, vous acceptez l'utilisation de cookies destinés à améliorer la performance de ce site et à vous proposer des services et contenus personnalisés.

X

Anatole Chessel

Maitre de Conférences - Ecole polytechnique
Pièce : 84-20 12
Tél :+33 (0) 16933 5014
anatole.chessel at polytechnique.edu
ORCID iD iconorcid.org/0000-0002-1326-6305
       
 

 

Thematique de recherche


Bioimagerie computationnelle pour les gros jeux de donnée d'imagerie: Comment manipuler, analyser, visualiser les gros jeux de donnée d'imagerie, gros par le nombre de conditions (imagerie à haut contenu/haut débit -HT/HC-) ou la taille (microscopie block face ou à feuille de lumière). C'est en intégrant pleinement ces données dans les programmes de recherche de biologie quantitative qu'ils pourront donnée leur pleine valeur et jouer leur rôle dans la compréhension de système biologique complexe.

 

Background


2015-présent: MdC at Laboratoire Pour l'Optique et les Biosciences, CNRS / INSERM / Ecole Polytechnique, France

2010–2015 Postdoc avec Rafael E. Carazo-Salas, University of Cambridge, Cambridge, UK

2007-2010 Postdoc avec Charles Kervrann, Inria Rennes et Jean Salamero, Insitut Curie, Paris

2004-2007 PhD, avec Frederic Cao (Inria) and Ronan Fablet (Ifremer, Telecom Bretagne) al'Ifremer, Brest

 

Enseignement


MODAL (Travaux pratique), pour ingenieurs polytechnicien en 2e année (Imagerie cellulaire pour l'étude du cytosquelette)

TREX (Travaux pratique), pour ingenieurs polytechnicien en 3e année (Homeostasie de la taille chez les levures)

Master 2 IMALIS, ENS Ulm, 'Bioimage informatics for neuroimaging' dans le module 'Optical Microscopy : principles and applications in Neurosciences'

 

Publications


Publications séléctionnées:

Osokin, A., Chessel, A., Carazo, S.R.E. and Vaggi, F., 2017. GANs for Biological Image Synthesis. In Proceedings of the IEEE International Conference on Computer Vision (ICCV 2017). IEEE.

Chessel, A., 2017. An Overview of data science uses in bioimage informatics. Methods.

Williams, E., Moore, J., Li, S.W., Rustici, G., Tarkowska, A., Chessel, A., Leo, S., Antal, B., Ferguson, R.K., Sarkans, U., Brazma, A., Carazo Salas, R.E. and Swedlow, J.R. 2017. Image Data Resource: a bioimage data integration and publication platform. Nature, 201, p.7.

Graml, V.*, Studera, X*., Lawson, J.L.*, Chessel, A.*, Geymonat, M., Bortfeld-Miller, M., Walter, T., Wagstaff, L., Piddini, E. and Carazo-Salas, R.E., 2014. A genomic Multiprocess survey of machineries that control and link cell shape, microtubule organization, and cell-cycle progression. Developmental cell, 31(2), pp.227-239.

Chessel, A., Cinquin, B., Bardin, S., Salamero, J. and Kervrann, C., 2009, June. Computational geometry-based scale-space and modal image decomposition: Application to light video-microscopy imaging. In Internationale Conference on Scale Space and Variational Methods (pp. 770-781).

 

List complète sur google scholar